هدف اصلی سپتیک تانک این است که به طور موقت فاضلاب را حفظ و ذخیره کند تا مواد جامد، چربی ها، روغن ها و گریس ها (FOG) قبل از جریان یافتن فاضلاب به سمت زهکش جدا شوند. مخزن به طور کلی به گونه ای طراحی شده است که یک زمان نگهداری 2 روزه برای ته نشین شدن فاضلاب فراهم کند. جامدات سنگین به پایین فرو می روند و لایه ای از "لجن" را تشکیل می دهند، در حالی که جامدات سبک و FOG یک "لایه کف" شناور را تشکیل می دهند.
حداقل اندازه مخزن برای یک خانه یک خانواده معمولاً 1000 گالن است. انواع مختلفی از مخازن برای استفاده در رود آیلند تأیید شده اند مخازن می توانند از نظر اندازه، پیکربندی و جنس متفاوت باشند. مخازنی که قبل از استانداردهای دولتی فعلی (مصوب در سال 1970) نصب شده اند، می توانند از درام های فولادی تا سیلندرهای بتنی متفاوت باشند. مخازن فروش سپتیک تانک معمولاً از بتن ساخته می شوند، اگرچه مخازن فایبرگلاس به طور منظم در قسمت هایی با دسترسی محدود به تجهیزات سنگین استفاده می شود.
فضای داخلی مخازن نیز ممکن است متفاوت باشد، به طور کلی شامل یک یا دو محفظه است. مخازن تک محفظه دارای یک تقسیم کننده در انتهای خروجی هستند تا از خروج شناور از مخزن و ورود به زهکش جلوگیری کند. مخزن نشان داده شده در اینجا یک مخزن معمولی دو محفظه است که توسط یک تقسیم کننده به نام بافل تقسیم می شود. محفظه اول شامل 2/3 از حجم مخزن است، بخش دوم شامل 1/3 است. مخازن دو محفظه ای معمولاً بزرگتر از مخازن تک محفظه ای با ظرفیت 1500 گالن هستند. فاضلاب از محفظه اول به دوم از طریق شکافی در بافل در ارتفاعی که باید با "منطقه شفاف" یا شفاف ترین آب در مخزن مطابقت داشته باشد، جریان می یابد. جداسازی اضافی جامدات در محفظه دوم رخ می دهد. پیکربندی دو محفظه، همراه با حجم ذخیره سازی بیشتر برای ته نشینی و ذخیره زباله، تضمین می کند که بیشترین میزان ممکن جداسازی مواد جامد قبل از خروج فاضلاب از مخزن برای توزیع به زهکشی انجام می شود. به دلیل این حفاظت اضافی برای زهکشی، برخی از جوامع مانند شهر چارلزتاون برای ساخت و ساز جدید به مخزن 1500 گالنی دو محفظه ای سپتیک تانک فاضلاب نیاز دارند.